有些原料藥生產的主要工序需要在潔凈環境中進行，噴霧干燥是其質量控制的重要工序。為了原料藥的質量，噴霧干燥設備接觸物料的部分要采用不銹鋼材質，對于酸腐蝕性較強的物料選用316L不銹鋼。
原料藥經過噴霧干燥設備噴霧干燥后，還需要進一步完成制劑工藝，不同的生產要求會對噴霧干燥產品的物理性質提出不同的要求。
藥品的分裝一般按照體積來控制裝量，這就要求產品的堆密度穩定，產品的流動性要好，而口服沖劑則往往要求速溶性。改變霧化的分散度或適當改變操作條件以控制干燥速率，可以制得具有不同堆密度的產品，但變化的幅度有限。
噴霧干燥機作為一種干燥物料且起到良好的分離和回收物料的裝置使用越來越廣。在工業中應用時，不但可以用于催化劑的干燥，且同時還能用于化學肥料和陶瓷原料等不同的物料的干燥和回收使用。
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